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génétique

Message par bye Jeu 28 Mai - 14:25

Génétique : des scientifiques créent des singes fluorescents

Des chercheurs japonais ont créé la première lignée de singes modifiés génétiquement pour devenir verts fluorescents sous l'effet de rayons ultra-violets, ouvrant de nouvelles perspectives à la recherche médicale, selon une étude parue, mercredi 27 mai, dans la revue Nature. Les scientifiques ont introduit dans des
embryons de ouistitis à pinceaux blancs (Callithrix jacchus) à l'aide d'un virus la protéine fluorescente GFP, originellement extraite d'une
méduse.
Les embryons ont ensuite été implantés sur sept mères porteuses,
dont trois ont fait des fausses couches, les quatre autres donnant
naissance à cinq petits. A la deuxième génération, le gène de la GFP était présent dans les cellules reproductrices de deux de ces cinq singes. L'un des deux l'a ensuite transmis à la génération suivante.
La découverte et l'utilisation de la GFP, aujourd'hui un marqueur
couramment utilisé pour explorer l'intérieur des cellules vivantes,
ont été récompensés l'an dernier par le prix Nobel de chimie.

OBSERVER LES PATHOLOGIES HUMAINES

Des expériences similaires avaient déjà été conduites sur des souris
et des rats, mais la plus grande proximité entre le singe et l'homme
laisse entrevoir la possibilité d'implanter d'autres gènes chez le
singe, pour observer des pathologies humaines. Ce type
d'expérience sur les singes est controversé parce que, selon ses
détracteurs, il ouvre la voie à des manipulations sur le génome humain.
Des expériences antérieures avaient échoué à insérer un gène dans les cellules reproductives pour transmettre la transformation génétique aux générations suivantes.

La prochaine étape consistera à implanter à ces ouistitis
transgéniques des maladies comme celle de Parkinson ou la
sclérose latérale amyotrophique (maladie de Charcot). Mais selon des spécialistes américains qui publient un commentaire dans Nature, cette espèce de singe ne se prête pas aussi bien que les babouins ou les singes rhésus à la réplication de maladies humaines.

Source : [/size][size=9]http://www.lemonde.fr/planete/article/2009/05/28/genetique-des-scientifiques-creent-des-singes-fluorescents_1198973_3244.html

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Message n°2

Re: génétique

Message par bye Lun 15 Juin - 19:57

Vers une meilleure compréhension de la biologie des bovins : la
séquence du génome de la vache entièrement décryptée

Un consortium international conduit par le Centre de séquençage du Baylor College of Medicine à Houston (USA) publie dans la revue « SCIENCE » la première analyse détaillée de la séquence du
génome bovin, à laquelle a contribué l’INRA de Jouy-en-Josas. Ce travail apporte des informations considérables sur la biologie de cette espèce et sur l’évolution et l’analyse comparée des mammifères. Il aura des applications nombreuses pour les filières bovines, en élargissant les outils et les critères pour la sélection des animaux.

Le détail de ces résultats est publié dans « SCIENCE » du 24 avril 2009.

La vache est le troisième animal domestique dont le génome est
entièrement séquencé, après celui du poulet et du chien. Conduit par un consortium international, le séquençage du génome bovin a nécessité 6 années de travail et a impliqué plus de 300 scientifiques issus de 25 pays, pour le séquençage proprement
dit mais surtout pour l’assemblage, l’annotation et l’analyse des
résultats.

Outre la séquence d’une vache femelle de race Hereford parue
dans un premier article, un second portant sur la structure des
populations bovines décrit plus spécifiquement le projet HapMap bovin, visant à produire une cartographie de la diversité génétique dans les différentes populations, entre grands rameaux taurins et zébus, et ce jusque dans les différentes races bovines.

Des résultats déterminants pour comprendre l’évolution des espèces

Conclusion importante issue de ce séquençage, le génome bovin est beaucoup plus proche de celui de l’homme que peut l’être celui de la souris ou du rat. Il comprend au moins 22 000 gènes, dont la plupart se retrouvent chez l’homme. La majorité des chromosomes bovins correspondent à de grands fragments de chromosomes
humains, parfois des chromosomes entiers. La grande conservation du génome entre ces deux espèces est expliquée par l’existence d’un ancêtre commun à l’homme et au bovin remontant à environ 95 millions d’années. Les réarrangements survenus ultérieurement sont principalement localisés dans les gènes impliqués dans l’immunité, le métabolisme et la digestion. Ces changements pourraient expliquer l’efficacité des ruminants à convertir des fourrages pauvres énergétiquement en viande et lait.
En parallèle du séquençage, le projet HapMap bovin, a dessiné
une cartographie de la diversité génétique dans les différentes
populations bovines. L’analyse de près de 500 animaux de 17
populations, y compris la race française Limousine, montre que les
bovins constituaient une population originelle très diverse qui s’est
structurée sous l’effet de la domestication, la formation des races et la sélection. La diversité globale reste cependant aujourd’hui
considérable sur l’ensemble de l’espèce bovine. Depuis la
domestication il y a 8000 à 10 000 ans, la conduite des populations de bovins par l’homme a débouché aujourd’hui sur plus de 800 races
d’aptitudes variées. Les zébus sont plus diversifiés que les taurins,
ce qui est cohérent avec l’hypothèse de foyers de domestication
distincts et d’une base initiale plus large pour les zébus.

Améliorer les processus de sélection des populations bovines

Les connaissances acquises par ce séquençage ont des
implications considérables pour les filières bovines tant pour le lait que pour la viande mais aussi en matière de reproduction ou d’adaptation des espèces (robustesse, bien-être), de techniques d’élevage et d’impacts environnementaux. La sélection génomique des meilleures populations pratiquée par les éleveurs sera ainsi optimisée. Elle consiste à sélectionner des reproducteurs sur la base de leur valeur génétique prédite à partir de marqueurs génétiques répartis sur tout le génome.

Cette approche est rendue possible par la disponibilité, pour un
nombre croissant d’espèces, de puces à ADN constituées de 50 000 à 60 000 marqueurs. Les données issues du séquençage permettent le développement d’un très grand nombre de marqueurs génétiques et d’outils de génotypage à haut débit, renouvelant complètement les méthodes de gestion des populations pour une sélection de nouveaux caractères. Ainsi les méthodes d’élevage pourront être plus justement adaptées à la physiologie des
animaux et de fait plus durables.
La connaissance du génome va aussi faciliter l'identification des
mutations responsables de pathologies chez les bovins.

L'ensemble de ces résultats est entièrement disponible pour les
scientifiques de tous pays par l'intermédiaire de bases de données
publiques. Le consortium international a permis l'accès à la séquence de la vache, depuis août 2006, par l'intermédiaire de plusieurs sites internet qui ont déjà été utilisés par les chercheurs, notamment pour la sélection génomique.
Les chercheurs vont désormais continuer à explorer en profondeur cette séquence.

Le Consortium international conduit par différentes institutions nord- américaines (Baylor College, USDA, Universités) a été financé
principalement par des fonds nord-américains (NHGRI, USDA, Etat du Texas, Genome Canada) ainsi que par quelques autres Etats (Australie, Nouvelle Zélande, Norvège). Les associations de race, dont France Limousin Sélection, ont participé au financement du programme HapMap.
L’INRA a contribué par ses réalisations préalables au séquençage, en particulier une carte physique complète du génome, par des cartes d’irradiation de haute densité, par la production de
marqueurs génétiques et par son travail d’annotation. Ces données sont le fruit d’un long travail de cartographie débuté dans les années 80 et qui a mobilisé de nombreux chercheurs.

......................................................................................

Référence :"The Genome Sequence of Taurine Cattle : A window to ruminant biology and evolution" SCIENCE, 24 avril 2009, vol 324, 522-528.

The Bovine Genome Sequencing and Analysis Consortium* Christine G. Elsik1, Ross L. Tellam2, Kim C. Worley3.

*La liste complète des auteurs et leurs appartenances se trouve dans le fichier ci-dessous. 1Department of Biology, 406 Reiss, 37th and O Streets, NW, Georgetown University, Washington, DC
20057, USA. E-mail: ce75@georgetown.edu

2CSIRO Livestock Industries, 306 Carmody Road, St. Lucia, QLD 4067, Australia. E-mail: ross.tellam@csiro.au 3Human Genome Sequencing Center, Department of Molecular and Human
Genetics, Baylor College of Medicine, MS BCM226, One Baylor Plaza, Houston, TX 77030, USA. E-mail:kworley@bcm.ed

Consulter la liste complète des auteurs de la publication

Rédacteur :Service Presse INRA,
tél : 01 42 75 91 69

Mathilde Maufras

Contacts :
Contacts scientifiques pour la France :
André Eggen
Centre de Jouy-en-Josas - UMR Génétique animale et biologie
intégrative (GABI)
Tél : 01 34 65 24 24
Andre.Eggen@jouy.inra.fr

Eve Devinoy
Centre de Jouy-en-Josas – Unité Génomique et physiologie de la
lactation (GPL)
Tél : 01 34 65 29 21 ou 01 34 65 25 41
Eve.Devinoy@jouy.inra.fr

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Message n°3

Re: génétique

Message par bye Sam 4 Fév - 18:52

La machine qui décode votre gnome grande vitesse

C’est une machine pas plus grande qu’une photocopieuse, qui permet de décoder l’ensemble du génome d’une personne en deux heures et pour moins de 1 000 dollars, selon son fabricant. Ion Proton Sequencer, cet appareil qui décrypte les trois milliards de « paires de base » du génome humain grâce à des puces électroniques, a été présenté au Forum économique mondial de Davos. Son créateur, Jonathan Rothberg, est directeur général de l’entreprise états-unienne de biotechnologie Ion Torrent Systems, filiale de la société Life Technologies.

L’appareil doit aider les équipes médicales à poser un diagnostic beaucoup plus rapidement qu’aujourd’hui – le séquençage de génome prend actuellement une semaine environ. Et même de prévoir de futurs problèmes de santé (Parkinson, cancer, anévrismes…) grâce à l’analyse de l’ADN des patients en un temps record. À Davos, Jonathan Rothberg a estimé que son invention apportait un changement aussi important que le passage de l’ordinateur occupant toute une salle au PC individuel. Et prédit que la taille de l’appareil pourra être encore réduite, pour être un jour transportable à la main. Voilà pour le côté positif.

Problème : cette machine « simple d’utilisation » et « low cost », comme le vante son fabricant, ouvre la voie à une généralisation du séquençage ADN, avec tous les risques et dérives possibles liés à la découverte de prédispositions génétiques. Un marché sur lequel travaillent déjà les compagnies pharmaceutiques, qui produisent de plus en plus de médicaments ciblant des variantes génétiques particulières. Cette généralisation pose aussi la question de l’accès aux résultats du séquençage – compagnies d’assurance ou employeurs ayant un intérêt patent à connaître certaines prédispositions génétiques. Avec peut-être bientôt le séquenceur « de poche », permettant de lire le génome d’une personne à son insu, à partir d’un cheveu ou de quelques cellules ? Bienvenue à Gattaca…

http://www.bastamag.net/article2101.html

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